در چند سال گذشته، پوهنتون‌ها و موسسات تحصیلات عالی خصوصی زیادی تأسیس شده و شمار زیادی از متقاضیان تحصیلات عالی را جذب و آموزش داده اند. موسسات تحصیلات عالی خصوصی، هرچند زیر نظر وزارت تحصیلات عالی فعالیت دارند، اما بسیاری از این موسسات مطابق معیارهای پیش‌بینی‌شده این وزارت عمل نمی‌كنند.